Инадзума 11: Перезагрузка — Реформация футбола

После завершения Футбольного Фронтира сборная «Инадзума Джапан» прекращает совместную деятельность, а её участники расходятся по разным направлениям. Мамору Эндо принимает решение продолжить обучение за границей, рассчитывая развить навыки и получить новый опыт. Спустя время он возвращается в Японию и обнаруживает, что структура футбольных соревнований полностью изменилась. Управление всеми лигами переходит к организации «Протокол Омега», внедрившей жёсткую систему анализа, контроля и стандартизации матчей.

Игроки обязаны следовать заранее рассчитанным алгоритмам, исключающим импровизацию и эмоциональные действия. Тренеры утрачивают право принимать самостоятельные решения, заменяясь автоматизированными программами. Мамору сталкивается с бывшими спортсменами, утратившими мотивацию и индивидуальный стиль. Попытки играть по старым принципам приводят к дисквалификациям и отстранениям. Осознавая масштаб изменений, Мамору начинает искать союзников, разделяющих прежние ценности футбола.